RICHARD DAWKINS - "THE ANCESTOR'S TALE" DEN NOTLAR

Evrimcilerin, hayatta kalan iki (veya daha fazla) soyu karşılaştırarak bir ortak atanın yerini "kestirdikleri" söylenebilir.

• Tarım, muhtemelen bağımsız olarak Çin'de ve Nil kıyılarında ve yeni dünyada tamamen bağımsız olarak ortaya çıktı.
• Arkeoloji, yaklaşık 40.000 yıl önce türümüzün başına çok özel bir şey gelmeye başladığını öne sürüyor.
• Büyük İleri Atılım'dan önce, insan yapımı eserler bir milyon yıldır neredeyse hiç değişmemişti. Bazıları bunun dilin kökeni ile çakıştığını düşünüyor.
• Herhangi bir nesildeki bireylerin yaklaşık yüzde 80'i kuramsal olarak uzak gelecekte yaşayan herkesin atası olacaktır.
• AB0 polimorfizmi şempanzelerde de bulunur.
• Neandertal mitokondrileri, hayatta kalan tüm insanlardan oldukça farklıdır, bu da Neandertallerin Avrupalılara diğer modern insanlardan daha yakın olmadığını düşündürür.
• Kasıtlı olarak yakılan kamp ateşleri, orman yangınlarından ve yanmış ağaç kütüklerinden ayrılacak biçimde toprakta manyetik kutuplar oluşturur.
• Bazıları, beynin konuşma alanlarının 2 milyon yıl öncesinden önce de genişlediğini söylüyor. Diğerleri, 60.000 yıl önceki Neandertallerin bile dilsiz olduğu sonucuna vardı.
• Pek çok paleontolog için, büyük beyin bizim türümüzün ayırt edici özelliğidir.
• Modern insan beyni, eşdeğer boyuttaki bir memeli için olması gerekenden yaklaşık altı kat daha büyüktür.
• Louis Pasteur: Talih hazırlıklı zihinlerden yanadır.
• Elleri, taşımak için serbest bırakmak, iki ayaklılığın evrimi olarak değerlendirilir.
• Şempanze cinsel sorunları güçle çözer; bonobo güç sorunlarını cinsellikle çözer.
• İnsan DNA'sının yaklaşık yarısı, anlamsız dizilerin birden çok kopyasından oluşur.
• G-C eşleşmesi kimyasal olarak A-T eşleşmesinden daha güçlüdür.

• "Neighbor-Joining" yöntemiyle hesaplama hızlıdır, ancak evrimsel sürecin mantığını içermez. Bunlar tamamen benzerlik ölçüleridir. Cimrilik (Parsimony), açıklama ekonomisi anlamına gelir. En cimri açıklama, en az miktarda evrimsel değişiklik varsayandır. Tek bir hayvan türüne özgü farklılıklar bilgilendirici değildir. Komşu birleştirme (Neighbor-Joining) yöntemi bunları kullanır, ancak cimrilik yöntemi onları tamamen yok sayar. Cimrilik, birden fazla tür tarafından paylaşılan bilgilendirici değişikliklere dayanır.
• Bayes filogenetiği, maksimum olabilirliğe alternatif bir yaklaşımdır. En olası tek ağaca inanmak yerine, tüm olası ağaçlara bakmalı, ancak daha olası olana orantılı olarak daha fazla güven vermeliyiz. Bayes yöntemi kullanılırken olasılıklar otomatik olarak hesaplanır.
• Önyükleme (Bootstrap) yöntemi, son ağaçta ne kadar fark yarattığını görmek için verilerin farklı bölümlerini tekrar tekrar yeniden örnekler.
• Benzer yöntemler "çakı" ve "ayrışma indeksi" dir. Hepsi, her bir dalın ağacı işaret ettiğine ne kadar inanmamız gerektiğinin ölçütleridir.
• DNA'nın farklı bölümleri farklı soy ağaçlarına sahip olabilir.
• Genel olarak memeliler, muhtemelen omurgalılar arasında en zayıf renk görüşüne sahiptir.
• Yeşil ve kırmızı opsinlerimizi yapan genler birbirine çok benzer ve X kromozomu üzerindedir.
• Polimorfizm, bir popülasyonda, bir genin iki veya daha fazla alternatif versiyonunun eşzamanlı varlığıdır. Bir popülasyonda istikrarlı bir polimorfizm için iki ana öneri vardır:

1- Frekansa bağlı seçilim (yeşil maymunlar-yeşil meyveler / kırmızı maymunlar-kırmızı meyveler)

2- Heterozigot avantajı (orak hücreli anemi; heterozigot bireyler sıtmaya karşı korunur. Heterozigot durumda sistik fibroz geni koleraya karşı koruma sağlıyor gibi görünmektedir.

• Erkekler kırmızı-yeşil renk körlüğüne kadınlara göre daha sık yakalanırlar.
• Çeşitli çalışmalar, tipik bir insan geninin eşinin ortaya çıkmasının ortalama olasılığının, milyon yılda yaklaşık yüzde 0,1 ila 1 arasında olduğunu bulmuştur.
• Yaşayan primatlar, lemurlar, onların akrabaları ve geri kalanlar olarak ikiye ayrılabilir.
• Gondwana, tüm bitki ve hayvan türlerinin yaklaşık %5'ini barındırır ve bunların %80'inden fazlası başka hiçbir yerde bulunmaz.
• Son moleküler kanıtlar, Afrika anakarasındaki birkaç türün, bazı Madagaskar kemirgenleriyle, bazı Madagaskar kemirgenlerinin birbirleriyle olduğundan daha yakın akraba olduğunu gösteriyor. Bu, Afrika'dan çoklu göçün göstergesi gibi görünebilir. Ancak asıl kurucu Hindistan'dandır. Afrika türlerinin ataları Madagaskar üzerinden Hindistan'dan geldiler.
• Madagaskar'ı yok ederseniz, dünyadaki toplam kara alanının yalnızca binde birini, ancak tüm hayvan ve bitki türlerinin tamamının %4'ünü yok etmiş olursunuz.
• Boş, eşyasız, susuz ve odunsuz bir kafese hapsedilen tutsak kunduzlar, sanal bir baraj duvarına sanal ahşap yerleştiriyor gibi görünüyor, hayalet çubuklarla acıklı bir şekilde hayalet bir duvar inşa etmeye çalışıyorlar, hepsi de sert, kuru hapishanelerinin düz zemini üzerinde.
• Tüm Carnivora'lar etobur (Panda) değildir.
• Suaygırları balinalara, domuzlar gibi diğer çift parmaklı toynaklı hayvanlar da dahil olmak üzere diğer herhangi bir hayvana olduğundan daha yakın kuzenlerdir.

• Tanrı ornitorenkleri yarattığında kötü bir gün geçiriyordu. Atölye zemininde kalan bazı yedek parçaları bulunca onları israf etmek yerine birleştirmeye karar verdi.
• Yok olma neredeyse tüm türlerin nihai kaderidir. Belki de şimdiye kadar var olan türlerin %99'unun nesli tükenmiştir. Bununla birlikte, milyon yıl başına yok oluş oranı sabit değildir ve yalnızca ara sıra kitlesel yok oluş için keyfi olarak kabul edilen eşik olan %75'in üzerine çıkar.
• Alabalıklar, köpek balıklarından ziyade insanlara daha yakın kuzenlerdir.
• Memeli benzeri sürüngenler, dinozorların ortaya çıkışından önce ortaya çıktı.
• 1896'da Ilinois Eyalet Tarım Laboratuvarı mısır tohumlarındaki yağ içeriğine yönelik ıslah çalışmalarına başladı.
• Geoffrey Miller, insan genlerinin %50 kadarının kendilerini beyinde ifade ettiğini öne sürüyor.
• Evrim artık düşünen insanlar tarafından evrensel olarak kabul edilen bir gerçektir.
• Bazı biyologlar insanı genç maymun olarak görüyor.
• Çamur atlayanlar yarım metreden fazla zıplayabilirler; Tırmanan balıklar, av aramak için mangrov ağaçlarına tırmanabilirler.
• Hemen hemen tüm hayvan embriyoları gastrulasyon aşamasından geçer, bu da muhtemelen bunun çok eski bir özellik olduğu anlamına gelir. Gastrulasyon sırasında top, iki katmanlı bir kap oluşturacak şekilde girintilidir.
• Protostome "birinci ağız", deuterostome ise "ikinci ağız" anlamına gelir. Protostomlarda çok daha fazla sayıda hayvan filumu bulunur.
• "Gözün" hayvanlar aleminin çeşitli yerlerinde bağımsız olarak 40'tan fazla kez evrimleştiği tahmin edilmektedir.
• Eğer tek bir yerel ırk dışında tüm insanlar yok olsaydı, insan türündeki genetik çeşitliliğin büyük çoğunluğu korunmuş olurdu.
• Kan alıp protein moleküllerini karşılaştırırsanız ya da genlerin kendilerini sıralarsanız, dünyanın herhangi bir yerinde yaşayan herhangi iki insan arasında, iki Afrika şempanzesi arasında olduğundan daha az fark olduğunu göreceksiniz.
• Şempanzeler çok uzun zaman önce genetik bir darboğazdan geçmediler.

• Sempatrik türleşme böcekler arasında "gerçek" coğrafi türleşmeden daha yaygındır. Hatta böcekler için türleşme olaylarının çoğu sempatrik olabilir.
• Bazı erken fosil böceklerin üç çift kanadı vardı.
• Hox genleri hemen hemen her hayvanda bulunmuştur; ancak bitkilerde, mantarlarda veya tek hücreli organizmalarda bulunmaz. Bitkiler ve mantarlar homeobox genlerine sahiptir ancak Hox genlerine sahip değildir.
• Hox geninin yaşamdaki görevi, vücudun neresinde olduğunu bilmek ve böylece aynı hücredeki diğer genlere bilgi vermektir.
• Homeobox, 180 kod harfinden oluşan bu teşhis dizisidir ve bir "homeobox geni", bu 180 harfli homeobox dizisini herhangi bir yerinde içeren bir gendir. Hox adı tüm homeobox genleri için değil, yalnızca bir hayvanın vücudu boyunca konumu belirleyen ve neredeyse tüm hayvanlarda homolog olduğu ortaya çıkan doğrusal gen dizileri için kullanılır.
• Pax 6, hücrelere göz yapmalarını söylemekten sorumludur. Her ne kadar iki hayvanda üretilen gözler tamamen farklı olsa da, aynı gen, Drosophilla ve fare gibi hayvanlarda da gözleri farklı kılmaktadır. Hox genlerine benzer şekilde Pax 6 da hücrelere nasıl göz yapılacağını söylemez. Onlara sadece göz yapılacak yerin burası olduğunu söyler.
• Tinman genleri, hücrelere kalp yapmalarını söylemekten sorumludur.
• Bdelloidler oldukça başarılı bir hayvan grubudur; bu gupta şimdiye kadar tek bir erkek bulunamadı. Şu anda 360 türden oluşan tam bir aseksüel sınıf olarak varlığını sürdürmektedir.
• Yaşlı hayvan çeşitliliğine dair ipuçları var. Kambriyen'in başlangıcından yirmi milyon yıl önce, Geç Prekambriyen'in Ediakaran Dönemi'nde, Güney Avustralya'daki Ediacara Tepeleri'nden adını alan Ediacaran faunası adı verilen gizemli bir hayvan grubunun dünya çapında yaygınlaşması yaşandı.
• J.B.S. Haldane, nesil başına orantılı değişime dayanan bir evrim hızı birimi olan Darwin'i önerdi.
• Moleküler saatler sonuçta fosillerin kalibrasyonuna bağlıdır.
• Trichoplax, çok hücreli hayvanlar arasında en küçük genoma ve en basit vücut organizasyonuna sahiptir. Bizdeki 200'den fazla hücre tipine karşılık, vücudunda sadece dört hücre tipi bulunur. Ve tek bir Hox genine sahip olduğu görülüyor. Trichoplax gerçek hayvanlar arasında en uzak kuzenimizdir.
• Simbiyotik işbirliğinin etkileyici başarısı, basidiomisetler ve bağımsız olarak yeniden evrimleşen ascomycet'ler, likenleri oluşturmak için algler veya siyanobakterilerle birleşimler oluşturur.
• Yaşayan en büyük organizma olan Sequoiadendron giganteum' un çevresi 30 metrenin üzerinde, boyu ise 80 metrenin üzerindedir ve tahmini ağırlığı 1260 tondur. Yaşı 3000'den fazladır ve yalnızca kabuğu yaklaşık bir metre kalınlığındadır.

• Binlerce yıl boyunca manyetik kuzey aniden manyetik güneye dönüştü, sonra tekrar tersine döndü. bu son 10 milyon yılda 282 kez yaşandı. Manyetik kuzey kutbu her halükarda nadiren gerçek coğrafi Kuzey Kutbu ile tam olarak çakışır. "Dönüş" sırasında, bazen birden fazla manyetik kuzeyin ve birden fazla manyetik güneyin geçici olarak ortaya çıkmasını içeren, alan kuvveti ve yönünde büyük ve karmaşık değişikliklerle birlikte, bir manyetik karışıklık ara dönemi vardır.
• Sedimanter kayaçlarda paleomanyetizma görülebilir.
• Nükleer dönüşüm, öngörülebilir bir olasılıkla olsa da, ara sıra öngörülemeyen bir anda değişme eğilimi gösterir.
• Alfa bozunmasında çekirdek bir alfa parçacığını kaybeder (birbirine yapışmış 2 proton ve 2 nötron). Kütle sayısı bu nedenle dört birim azalır. U 238 ✒ Toryum 234
• Beta bozunmasında bir nötron bir protona dönüşür. Yani kütle numarası aynı kalır.
• Nötron-proton değişimi gerçekleştiğinde, nötron bir protonu devre dışı bırakır; yani kütle numarası aynı kalır. K 40 ✒ Ar 40
• C 14, 5730 yıllık yarı ömürle N 14'e bozunur.
• Atmosferde en bol bulunan gaz olan N 14'ün birkaç atomu, kozmik ışınların bombardımanı yoluyla sürekli olarak C 14'e dönüştürülmektedir. C 14'ün yaratılma hızı yaklaşık olarak sabittir.

• Kloroplastlar bir zamanlar serbest yaşayan yeşil bakterilerin uzak torunlarıdır.
• Bazı kloroplastlar bitki hücrelerine dolaylı olarak girdiklerine dair kanıtlar bulundurur; Kanıt, bazı kloroplastların çift zara sahip olmasıdır. Muhtemelen içteki orijinal bakterinin duvarı, dıştaki ise alglerin duvarıdır.
• Ancak kendi hücrelerimiz oksijenle ne yapacaklarını bilemezlerdi. Bunu yapan yalnızca mitokondri ve onların bakteriyel kuzenleridir.
• Mitokondri orijinal genomunun çoğunu kaybetmiştir.
• Hem kloroplastların hem de mitokondrilerin diğer prokaryotik grup olan Archaea ile değil, öbakterilerle yakınlıkları vardır. Ancak çekirdek genlerimiz Archaea'ya biraz daha yakın.
• Kimyasal olarak bazı bakterilere, bazı bakterilerin diğer bakterilere olduğundan daha benzeriz.
• Bir Amip, bakterilerin "gözleri" ile bakıldığında insandan neredeyse ayırt edilemez.
• Hayvanlar, bitkiler ve mantarlar hayat ağacının sadece üç küçük dalını oluşturur.
• Bir zincir mektubun, en azından okumaya yetecek kadar eğitimli, gelişmiş beyinlere sahip, bol miktarda aptala ihtiyacı vardır.
• İlk kopyalayıcı, daha önce benzeri görülmemiş bir şekilde ve kimyanın olağan yasalarından başka yardım almadan de novo, ab inito çalıştı.
• Atmosferinde serbest oksijen bulunan hiçbir gezegende hayat oluşamazdı.
• Orijinal kopyalayıcı olarak nihai değeri ne olursa olsun, RNA kesinlikle DNA'dan daha iyi bir adaydır.
• Her biri yaklaşık 70 yapı bloğu uzunluğunda bir dizi küçük transfer RNA'sı (tRNA) vardır. tRNA'ların her biri kendisini yirmi çeşit doğal amino asitten yalnızca birine seçici olarak bağlar.
• Hiperdöngü, balık sayısının beslendikleri Daphnia (su pireleri) popülasyonuna bağlı olması gibi bir bağımlılıktır. Balık sayıları da balık yiyen kuşların popülasyonunu etkiliyor. Kuşlar, üzerinde Daphnia'nın geliştiği alglerin çoğalmasına yardımcı olan guano sağlıyor.
• Çift sarmal sistem kanıt düzeltmeye elverişlidir. Bu prensibe dayalı düzeltmeler, mutasyon oranlarını milyarda bir düzeyine indirir; bu da bizimki gibi büyük genomları mümkün kılar.
• Yabani RNA (QB), 74 nesil (test tüpleri içinde) sonrasında 3600 boncuk uzunluğundan yalnızca 550 boncuk uzunluğuna evrildi.
• Makroevrim ile mikroevrim arasında iddia edilen ayrım: Makroevrim (milyonlarca yıllık büyük ölçekteki evrim), mikroevrimin (bireysel yaşam ölçeğindeki evrimin) milyonlarca yıl boyunca devam etmesine izin verildiğinde elde ettiğiniz şeydir.